Offiziell am 26. September 2009 eingeweiht, nimmt das Museo Lapidario della città di Todi einige Räumlichkeiten des alten Klosters San Giovanni Battista, besser bekannt als „Monastero delle Lucrezie“ („Lukrezienkloster“), ein. Der Name leitet sich von der adeligen Lucrezia della Genga aus Ancona ab, die 1425 den 12 Mitschwestern des dritten franziskanischen Frauenordens ein Gebäude dicht an den Stadtmauern überließ. In der Apside der alten Kirche, die S. Giovanni (Hl. Johannes) gewidmet ist, und in den zwei angrenzenden Salons, finden heute zahlreiche archäologische Steinfunde Platz, die die lange Geschichte der Stadt vom Römischen Zeitalter über die Renaissance bis hin zur Moderne bezeugt. Die Sammlung gehört nach der Sammlung von Gubbio zu den ältesten Sammlungen Umbriens.