El conjunto de San Francisco, formado por la iglesia y el antiguo convento adyacente, se levanta en Trevi en el lugar donde, según la leyenda, San Francisco predicaba hablando con un burro que rebuznaba, logrando callarlo. La iglesia fue construida sobre un antiguo edificio del año 1268, dedicado a la Virgen; fue ampliada en el siglo XIV y restaurada un siglo más tarde. La arquitectura es sencilla y sin adornos, según el modelo de las órdenes mendicantes: una sola nave con cubierta de celosías de madera, ábside central pentagonal y dos capillas rectangulares a los lados. Conserva frescos de los siglos XV y XVI y una bella cruz de la primera mitad del siglo XIV. Objeto de gran valor y conservado en el interior de la iglesia es el órgano: fue realizado por Paolo Pietro di Paolo de Montefalco en 1504 y es el ejemplar más antiguo de Umbría, uno de los más antiguos de Europa que aún existen de ese tipo, llamado «órgano de pared» durante el Renacimiento.
El convento fue fundado por los Frailes Menores Conventuales, que se convirtieron en una presencia fundamental para los trevani. De hecho,se les confió la custodia de las tres llaves del precioso archivo histórico de la ciudad, el llamado «Archivo de las Tres Llaves». El convento se desarrolla en torno al bello claustro formado por el pórtico, cuyos lunetos están pintados al fresco con episodios de la vida de San Francisco por Bernardino Gagliardi de Città di Castello, que los pintó allá por el 1645. En el siglo XVII el edificio fue reconstruido a partir de los cimientos, mientras que en 1833 fue renovado por el famoso arquitecto Giuseppe Valadier, quien lo hizo apto para albergar el colegio Lucarini, una prestigiosa institución, fundada dos siglos antes por Virgil Lucarini, un exponente de una acaudalada familia trevana.
Hoy en día, en el antiguo convento se ha establecido el complejo museístico de San Francisco, inaugurado en 1996 tras las obras de renovación y restauración. Originalmente se crearon el Museo de la Ciudad y del Territorio y la Pinacoteca, mientras que tres años más tarde le tocó al Museo de la Cultura del Olivo. Finalmente, en 2006, el complejo se completó con la incorporación del Antiquarium. En el interior de la Pinacoteca se conservan obras de excepcional calidad de la época medieval y renacentista, como la Coronación de la Virgen por Giovanni di Pietro, llamado lo Spagna, la Virgen y el Niño de Pinturicchio, y unretablo de la Asunción de la Virgen, realizado en 1640 por Alessandro Turchi, llamado l’Orbeto. El museo arqueológico contiene materiales de excavación encontrados en Pietrarossa, el lugar donde se encontraba la antigua Trebiae romana.